在肿瘤药物研发中,速度和质量是使研发顺利进展的关键。药明康德的辉源生物团队(HDB)推出了个性化的抗肿瘤药物细胞筛选平台(TCPS,Tumor Cell Panel Screening)。该平台帮助客户寻找新的抗肿瘤靶点,研究新的药理机制,筛选化合物活性,以及分析肿瘤药物的耐药性,同时也对临床前生物标记物的研究,临床前病人亚群的选择等方面提供关键性的、具有价值的生物信息和科学依据,致力于推动抗肿瘤药物的高效研发。
平台优势
1. 1000+ 株肿瘤细胞系,广泛涵盖各种肿瘤类型
HDB的TCPS平台收集了超过1000株来自于不同肿瘤类型与地域来源的细胞株,建立起了高质量、高标准的肿瘤细胞库。每批次的细胞株都严格经过STR确认和支原体阴性检测,并建立细胞的生长曲线图。其中600多株CCLE肿瘤细胞备有明确的基因分子水平信息,能够快速为客户提供多样化的选择和个性化的服务。

图一、HDB肿瘤细胞组织分布图 (18个不同组织器官,~1000株肿瘤细胞株)
2. 标准化实验流程,获取数据精、准、快,具有高度的重复性和可信性
通过不断优化提升,HDB以标准化、系统化、高通量的检测流程,帮助客户进行药物活性筛选(单药或者复合药),细胞株筛选,临床前生物标志物的发现等实验,为广大客户提供高质量的实验数据。
3.多层次多方位的检测方法,满足前期新药研发的多种需求
1) 细胞表型功能的检测 (Phenotypic Screen)
高通量增殖实验(2D、3D)
为表观遗传学项目提供超长时的增殖实验(14-21天)
细胞周期、凋亡、迁移等检测
不同种类细胞之间的相互作用检测,包括与免疫细胞的共培养实验
2) 靶点表达检测 (Target Expression Test)
靶点蛋白层面的检测(iQue/FACS,MSD,WesternBlot等等)
靶点mRNA、基因突变功能检测
3) 药物作用机理研究 (MOA study)
通过对基因表达数据、mRNA数据和小规模实验细胞数据的一体化分析,了解药物作用的基因通路。建立基因、蛋白质、药物等各种分子属性的可视化系统,构建分子之间相互作用关系网络。提供信号通路分析、上游调控分析、疾病与功能分析、调控效应分析、基因互作网络分析等。

表一、平台技术优势汇总
平台运用
1.通过高通量筛选寻找敏感性或耐药性的细胞株,或者寻找抗肿瘤药物的可愈性、适应症的癌器官。

图二、化合物在~600株肿瘤细胞中筛选,根据对15种癌症类型上的药效反应,寻求该药物在不同肿瘤疾病上的应用潜力
2.通过药物基因组学分析 (Pharmacogenomic Analysis),寻找具有统计学意义的相关性生物标志物,提供“个性化”治疗方案的可行性。

图三、生物标志物的发现
3.联合用药的抗肿瘤细胞增殖实验,可以根据客户需求,通过实验的设计,计算combination index, 从而得到相应的Synergy score,找出新的治疗方案。

图四、联合用药的抗肿瘤细胞增殖实验
4.使用高通量筛选方法,利用细胞流式技术(iQue)筛选高表达靶点的细胞株,进行药效反应的检测。

图五、在200多株细胞中筛选出与靶点相关的高表达细胞株
参考文献
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The Cancer Cell Line Encyclopedia enablespredictive modelling of anticancer drug sensitivity. Barretina Jet al., Nature. 2012 Mar 28
Cell line modeling for systems medicine incancers. Int J Oncol 2014
3D Models ofthe NCI60 Cell Lines for Screening Oncology Compounds. Mike Selby et. al SLASDiscovery 2017
Large-scale protein profiling in human celllines using antibody-based proteomics LinnFagerbergJ Proteome Res 2011
Comprehensive transcriptomic analysis of cell lines as models of primarytumors across 22 tumor types. KYuet al Nature 2019
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关于药明康德辉源生物HDB
辉源生物隶属于药明康德-研究服务部,是一家致力于高质量临床前药物研发外包服务的生物技术公司,为药明康德全资子公司。辉源生物总部位于上海,在美国圣地亚哥和新泽西设有运营分部。服务平台包括药物靶标验证、基于微孔板的体外药理学检测、活性化合物识别、先导化合物发现、治疗性抗体研发,药物代谢和毒理、体内药理学研究等一系列生物研发服务。公司目前与众多国内外制药企业和生物技术公司开展了广泛合作,并建立了良好的战略性伙伴关系。公司全面完整的技术服务和专业指导,为加速客户的药物研发项目创造了极大的价值,在业界赢得了很高的赞誉。
