【无标题】 barplot(reactome,showCategory=15)画图报错Error in ans[ypos] <- rep(yes, length.out = len)[ypos]

报错内容:

> barplot(reactome,showCategory=15)
Error in ans[ypos] <- rep(yes, length.out = len)[ypos] : 
  replacement has length zero
In addition: Warning message:
In rep(yes, length.out = len) : 'x' is NULL so the result will be NULL

解决方法:

有可能是因为根据既有的过滤标准没有被富集到的通路,放宽限定的阈值即可。例如pvalueCutoff = 1, qvalueCutoff = 1。

此外可通过设置label_format=参数,设置轴标签文字的每行字符数长度,过长则会自动换行。

参考[富集分析] 3、clusterprofile富集分析--下游可视化 - 简书 (jianshu.com)


版权声明:本文为weixin_54434521原创文章,遵循CC 4.0 BY-SA版权协议,转载请附上原文出处链接和本声明。