ubuntu18.04安装CCMpred

现在CCMpred已经停止更新了，不知道还要多久才能出个类似的好用的contact map计算工具。

安装环境：

ubuntu18.04
NVIDIA GTX1060
CUDA 10.0
cmake 3.8.0

这里记录的是CCMpred CPU版本的安装方法，GPU版本存在问题，暂时不做介绍，后期补上。

首先从官网下载CCMpred安装包，添加环境变量：

	git clone --depth=50 --branch=master https://github.com/soedinglab/CCMpred.git     CCMpred
	cd CCMpred/
	
	git checkout -qf 688e4ba1734bde553e7299ce058b08fae49bb248

	git submodule update --init --recursive`

	export CC=${CC:-gcc}`

	export CC_FOR_BUILD=${CC_FOR_BUILD:-gcc}

然后就行编译，安装，编译时需要禁用CUDA和多线程模块：

cmake -DWITH_CUDA=off -DWITH_OMP=off .
make

然后需要把CCMpred/bin/目录下的文件：ccmpred复制到根目录下的/bin/，就可以在命令行调用ccmpred了。
cp ./bin/ccmpred /bin/ccmpred

在命令行输入ccmpred测试：
完整过程图片：

使用示范：