每日一题：DNA序列

一、题目描述

一个DNA序列由A/C/G/T四个字母的排列组合组成。G和C的比例（定义为GC-Ratio）是序列中G和C两个字母的总的出现次数除以总的字母数目（也就是序列长度）。在基因工程中，这个比例非常重要。因为高的GC-Ratio可能是基因的起始点。

给定一个很长的DNA序列，以及要求的最小子序列长度，研究人员经常会需要在其中找出GC-Ratio最高的子序列。

输入描述：输入一个string型基因序列，和int型子串的长度 n
输出描述：找出GC比例最高的子串,如果有多个输出第一个的子串

二、思路分析

从头遍历字符串，下标 i 位置到 (i + n) 为一组，计算出每一组中包含 “G” 和 “C” 的个数，找出个数最多的一组，将这一组的第一个字符下标保存下来，此位置到该位置 + n 处表示的字符串就是 GC-Ratio 最高的子序列。

三，代码

import java.util.*;
public class Main {
        public static void main(String[] args) {
        Scanner input = new Scanner(System.in);
        while (input.hasNext()) {
            String str = input.next();
            int n = input.nextInt();
            int max = 0;
            int index = 0;
            for (int i = 0; i <= str.length()-n; i++) {
                int count = 0;
                for (int j = i; j < i+n; j++) {
                    if (str.charAt(j)=='G'||str.charAt(j)=='C')
                        count++;
                }
                if (count > max){
                    index = i;
                    max = count;
                }
            }
            System.out.println(str.substring(index, index+n));
        }
    }
}