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数据挖掘的五大流程:
- 获取数据
- 数据预处理
数据预处理是从数据中检测,纠正或删除损坏,不准确或不适用于模型的记录的过程可能面对的问题有:数据类型不同,比如有的是文字,有的是数字,有的含时间序列,有的连续,有的间断。也可能,数据的质量不行,有噪声,有异常,有缺失,数据出错,量纲不一,有重复,数据是偏态,数据量太大或太小数据预处理的目的:让数据适应模型,匹配模型的需求 - 特征工程:
特征工程是将原始数据转换为更能代表预测模型的潜在问题的特征的过程,可以通过挑选最相关的特征,提取特征以及创造特征来实现。其中创造特征又经常以降维算法的方式实现。可能面对的问题有:特征之间有相关性,特征和标签无关,特征太多或太小,或者干脆就无法表现出应有的数据现象或无法展示数据的真实面貌特征工程的目的:1) 降低计算成本,2) 提升模型上限 - 建模,测试模型并预测出结果
- 上线,验证模型效果
模块preprocessing:几乎包含数据预处理的所有内容
模块Impute:填补缺失值专用
模块feature_selection:包含特征选择的各种方法的实践
模块decomposition:包含降维算法
数据预处理 Preprocessing & Impute
数据无量纲化
无量纲化可以帮我们提升模型精度,避免某一个取值范围特别大的特征对距离计算造成影响。(一个特例是决策树和树的集成算法们,对决策树我们不需要无量纲化,决策树可以把任意数据都处理得很好。)
数据的无量纲化可以是线性的,也可以是非线性的。线性的无量纲化包括中心化(Zero-centered或者Meansubtraction)处理和缩放处理(Scale)。中心化的本质是让所有记录减去一个固定值,即让数据样本数据平移到某个位置。缩放的本质是通过除以一个固定值,将数据固定在某个范围之中,取对数也算是一种缩放处理
preprocessing.MinMaxScaler
当数据(x)按照最小值中心化后,再按极差(最大值 - 最小值)缩放,数据移动了最小值个单位,并且会被收敛到[0,1]之间,而这个过程,就叫做数据归一化(Normalization,又称Min-Max Scaling)。注意,Normalization是归一化,不是正则化,真正的正则化是regularization,不是数据预处理的一种手段。归一化之后的数据服从正态分布。
在sklearn当中,我们使用preprocessing.MinMaxScaler来实现这个功能。MinMaxScaler有一个重要参数,feature_range,控制我们希望把数据压缩到的范围,默认是[0,1]。
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
data = [[-1, 2], [-0.5, 6], [0, 10], [1, 18]]
#不太熟悉numpy的小伙伴,能够判断data的结构吗?
#如果换成表是什么样子?
import pandas as pd
pd.DataFrame(data)
#实现归一化
scaler = MinMaxScaler() #实例化
scaler = scaler.fit(data) #fit,在这里本质是生成min(x)和max(x)
result = scaler.transform(data) #通过接口导出结果
result
result_ = scaler.fit_transform(data) #训练和导出结果一步达成
scaler.inverse_transform(result) #将归一化后的结果逆转
#使用MinMaxScaler的参数feature_range实现将数据归一化到[0,1]以外的范围中
data = [[-1, 2], [-0.5, 6], [0, 10], [1, 18]]
scaler = MinMaxScaler(feature_range=[5,10]) #依然实例化
result = scaler.fit_transform(data) #fit_transform一步导出结果
result
#当X中的特征数量非常多的时候,fit会报错并表示,数据量太大了我计算不了
#此时使用partial_fit作为训练接口
#scaler = scaler.partial_fit(data)
BONUS: 使用numpy来实现归一化
import numpy as np
X = np.array([[-1, 2], [-0.5, 6], [0, 10], [1, 18]])
#归一化
X_nor = (X - X.min(axis=0)) / (X.max(axis=0) - X.min(axis=0))
X_nor
#逆转归一化
X_returned = X_nor * (X.max(axis=0) - X.min(axis=0)) + X.min(axis=0)
X_returned
preprocessing.StandardScaler
当数据(x)按均值(μ)中心化后,再按标准差(σ)缩放,数据就会服从为均值为0,方差为1的正态分布(即标准正态分布),而这个过程,就叫做数据标准化(Standardization,又称Z-score normalization)。
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
data = [[-1, 2], [-0.5, 6], [0, 10], [1, 18]]
scaler = StandardScaler() #实例化
scaler.fit(data) #fit,本质是生成均值和方差
scaler.mean_ #查看均值的属性mean_
scaler.var_ #查看方差的属性var_
x_std = scaler.transform(data) #通过接口导出结果
x_std.mean() #导出的结果是一个数组,用mean()查看均值
x_std.std() #用std()查看方差
scaler.fit_transform(data) #使用fit_transform(data)一步达成结果
scaler.inverse_transform(x_std) #使用inverse_transform逆转标准化
缺失值
impute.SimpleImputer
class sklearn.impute.SimpleImputer (missing_values=nan, strategy=’mean’, fill_value=None, verbose=0,copy=True)
在讲解随机森林的案例时,我们用这个类和随机森林回归填补了缺失值,对比了不同的缺失值填补方式对数据的影响。这个类是专门用来填补缺失值的。它包括四个重要参数:
参数 | 含义&输入 |
---|---|
missing_values | 告诉SimpleImputer,数据中的缺失值长什么样,默认空值np.nan |
strategy | 我们填补缺失值的策略,默认均值。输入“mean”使用均值填补(仅对数值型特征可用)输入“median"用中值填补(仅对数值型特征可用)输入"most_frequent”用众数填补(对数值型和字符型特征都可用)输入“constant"表示请参考参数“fill_value"中的值(对数值型和字符型特征都可用) |
fill_value | 当参数startegy为”constant"的时候可用,可输入字符串或数字表示要填充的值,常用0 |
copy | 默认为True,将创建特征矩阵的副本,反之则会将缺失值填补到原本的特征矩阵中去 |
data.info()
#填补年龄
Age = data.loc[:,"Age"].values.reshape(-1,1) #sklearn当中特征矩阵必须是二维
Age[:20]
from sklearn.impute import SimpleImputer
imp_mean = SimpleImputer() #实例化,默认均值填补
imp_median = SimpleImputer(strategy="median") #用中位数填补
imp_0 = SimpleImputer(strategy="constant",fill_value=0) #用0填补
imp_mean = imp_mean.fit_transform(Age) #fit_transform一步完成调取结果
imp_median = imp_median.fit_transform(Age)
imp_0 = imp_0.fit_transform(Age)
imp_mean[:20]
imp_median[:20]
imp_0[:20]
#在这里我们使用中位数填补Age
data.loc[:,"Age"] = imp_median
data.info()
#使用众数填补Embarked
Embarked = data.loc[:,"Embarked"].values.reshape(-1,1)
imp_mode = SimpleImputer(strategy = "most_frequent")
data.loc[:,"Embarked"] = imp_mode.fit_transform(Embarked)
data.info()
BONUS:用Pandas和Numpy进行填补其实更加简单
import pandas as pd
data = pd.read_csv(r"C:\work\learnbetter\micro-class\week 3
Preprocessing\Narrativedata.csv",index_col=0)
data.head()
data.loc[:,"Age"] = data.loc[:,"Age"].fillna(data.loc[:,"Age"].median())
#.fillna 在DataFrame里面直接进行填补
data.dropna(axis=0,inplace=True)
#.dropna(axis=0)删除所有有缺失值的行,.dropna(axis=1)删除所有有缺失值的列
#参数inplace,为True表示在原数据集上进行修改,为False表示生成一个复制对象,不修改原数据,默认False
处理分类型特征:编码与哑变量
为了让数据适应算法和库,我们必须将数据进行编码,即是说,将文字型数据转换为数值型。
preprocessing.LabelEncoder:标签专用,能够将分类转换为分类数值
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
y = data.iloc[:,-1] #要输入的是标签,不是特征矩阵,所以允许一维
le = LabelEncoder() #实例化
le = le.fit(y) #导入数据
label = le.transform(y) #transform接口调取结果
le.classes_ #属性.classes_查看标签中究竟有多少类别
label #查看获取的结果label
le.fit_transform(y) #也可以直接fit_transform一步到位
le.inverse_transform(label) #使用inverse_transform可以逆转
data.iloc[:,-1] = label #让标签等于我们运行出来的结果
data.head()
#如果不需要教学展示的话我会这么写:
from sklearn.preprocessing import LabelEncoder
data.iloc[:,-1] = LabelEncoder().fit_transform(data.iloc[:,-1])
preprocessing.OrdinalEncoder:特征专用,能够将分类特征转换为分类数值
from sklearn.preprocessing import OrdinalEncoder
#接口categories_对应LabelEncoder的接口classes_,一模一样的功能
data_ = data.copy()
data_.head()
OrdinalEncoder().fit(data_.iloc[:,1:-1]).categories_
data_.iloc[:,1:-1] = OrdinalEncoder().fit_transform(data_.iloc[:,1:-1])
data_.head()
preprocessing.OneHotEncoder:独热编码,创建哑变量
data.head()
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
X = data.iloc[:,1:-1]
enc = OneHotEncoder(categories='auto').fit(X)
result = enc.transform(X).toarray()
result
#依然可以直接一步到位,但为了给大家展示模型属性,所以还是写成了三步
OneHotEncoder(categories='auto').fit_transform(X).toarray()
#依然可以还原
pd.DataFrame(enc.inverse_transform(result))
enc.get_feature_names()
result
result.shape
#axis=1,表示跨行进行合并,也就是将量表左右相连,如果是axis=0,就是将量表上下相连
newdata = pd.concat([data,pd.DataFrame(result)],axis=1)
newdata.head()
newdata.drop(["Sex","Embarked"],axis=1,inplace=True)
newdata.columns =
["Age","Survived","Female","Male","Embarked_C","Embarked_Q","Embarked_S"]
newdata.head()
处理连续型特征:二值化与分段
sklearn.preprocessing.Binarizer
根据阈值将数据二值化(将特征值设置为0或1),用于处理连续型变量。大于阈值的值映射为1,而小于或等于阈值的值映射为0。默认阈值为0时,特征中所有的正值都映射到1。二值化是对文本计数数据的常见操作,分析人员
可以决定仅考虑某种现象的存在与否。它还可以用作考虑布尔随机变量的估计器的预处理步骤(例如,使用贝叶斯设置中的伯努利分布建模)
#将年龄二值化
data_2 = data.copy()
from sklearn.preprocessing import Binarizer
X = data_2.iloc[:,0].values.reshape(-1,1) #类为特征专用,所以不能使用一维数组
transformer = Binarizer(threshold=30).fit_transform(X)
transformer
preprocessing.KBinsDiscretizer
这是将连续型变量划分为分类变量的类,能够将连续型变量排序后按顺序分箱后编码。总共包含三个重要参数:
参数 | 含义&输入 |
---|---|
n_bins | 每个特征中分箱的个数,默认5,一次会被运用到所有导入的特征 |
encode | 编码的方式,默认“onehot”.“onehot”:做哑变量,之后返回一个稀疏矩阵,每一列是一个特征中的一个类别,含有该类别的样本表示为1,不含的表示为0“ordinal”:每个特征的每个箱都被编码为一个整数,返回每一列是一个特征,每个特征下含有不同整数编码的箱的矩阵"onehot-dense":做哑变量,之后返回一个密集数组。 |
strategy | 用来定义箱宽的方式,默认"quantile"。“uniform”:表示等宽分箱,即每个特征中的每个箱的最大值之间的差为(特征.max() - 特征.min())/(n_bins)“quantile”:表示等位分箱,即每个特征中的每个箱内的样本数量都相同"kmeans":表示按聚类分箱,每个箱中的值到最近的一维k均值聚类的簇心得距离都相同 |
from sklearn.preprocessing import KBinsDiscretizer
X = data.iloc[:,0].values.reshape(-1,1)
est = KBinsDiscretizer(n_bins=3, encode='ordinal', strategy='uniform')
est.fit_transform(X)
#查看转换后分的箱:变成了一列中的三箱
set(est.fit_transform(X).ravel())
est = KBinsDiscretizer(n_bins=3, encode='onehot', strategy='uniform')
#查看转换后分的箱:变成了哑变量
est.fit_transform(X).toarray(}
特征选择 feature_selection
从所有的特征中,选择出有意义,对模型有帮助的特征,以避免必须
将所有特征都导入模型去训练的情况
Filter过滤法
方差过滤
VarianceThreshold
VarianceThreshold有重要参数threshold,表示方差的阈值,表示舍弃所有方差小于threshold的特征,不填默认为0,即删除所有的记录都相同的特征。
from sklearn.feature_selection import VarianceThreshold
selector = VarianceThreshold() #实例化,不填参数默认方差为0
X_var0 = selector.fit_transform(X) #获取删除不合格特征之后的新特征矩阵
#也可以直接写成 X = VairanceThreshold().fit_transform(X)
X_var0.shape
import numpy as np
X_fsvar = VarianceThreshold(np.median(X.var().values)).fit_transform(X)
X.var().values
np.median(X.var().values)
X_fsvar.shape
相关性过滤
卡方过滤
卡方过滤是专门针对离散型标签(即分类问题)的相关性过滤。卡方检验类feature_selection.chi2计算每个非负特征和标签之间的卡方统计量,并依照卡方统计量由高到低为特征排名。
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier as RFC
from sklearn.model_selection import cross_val_score
from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2
#假设在这里我一直我需要300个特征
X_fschi = SelectKBest(chi2, k=300).fit_transform(X_fsvar, y)
X_fschi.shape
选取超参数K
%matplotlib inline
import matplotlib.pyplot as plt
score = []
for i in range(390,200,-10):
X_fschi = SelectKBest(chi2, k=i).fit_transform(X_fsvar, y)
once = cross_val_score(RFC(n_estimators=10,random_state=0),X_fschi,y,cv=5).mean()
score.append(once)
plt.plot(range(350,200,-10),score)
plt.show()
F检验
F检验,又称ANOVA,方差齐性检验,是用来捕捉每个特征与标签之间的线性关系的过滤方法。它即可以做回归也可以做分类,因此包含feature_selection.f_classif(F检验分类)feature_selection.f_regression(F检验回归)两个类。其中F检验分类用于标签是离散型变量的数据,而F检验回归用于标签是连续型变量的数据.
from sklearn.feature_selection import f_classif
F, pvalues_f = f_classif(X_fsvar,y)
pvalues_f
k = F.shape[0] - (pvalues_f > 0.05).sum()
过滤法总结
类 | 说明 | 超参数的选择 |
---|---|---|
VarianceThreshold | 方差过滤,可输入方差阈值,返回方差大于阈值的新特征矩阵 | 看具体数据究竟是含有更多噪声还是更多有效特征一般就使用0或1来筛选也可以画学习曲线或取中位数跑模型来帮助确认 |
SelectKBest | 用来选取K个统计量结果最佳的特征,生成符合统计量要求的新特征矩阵 | 看配合使用的统计量 |
chi2 | 卡方检验,专用于分类算法,捕捉相关性 | 追求p小于显著性水平的特征 |
f_classif | F检验分类,只能捕捉线性相关性要求数据服从正态分布 | |
f_regression | F检验回归,只能捕捉线性相关性要求数据服从正态分布 | 追求p小于显著性水平的特征 |
mutual_info_classif | 互信息分类,可以捕捉任何相关性不能用于稀疏矩阵 | 追求互信息估计大于0的特征 |
mutual_info_regression | 互信息回归,可以捕捉任何相关性不能用于稀疏矩阵 | 追求互信息估计大于0的特征 |